9.第三次衝擊是什麼？(1)人類補完計畫的內容就是這個。透過發動超大規模的反AT力場，將所有生命化為LCL(生命之源)，回到人類最初始的狀態。沒有戰爭、瘟疫與歧見。
(2)但能發動這招的只有生命的始祖，也就是亞當與莉莉絲。之後劇中所說「神」也是指他們。
(3)使徒本能地會尋找莉莉絲，但使徒若與莉莉絲融合就會成為神，可以發動第三次衝擊，因此SELLE要消滅所有使徒。
(3)碇源堂為了讓自己成為神，好執行他心中的人類補完計畫，偷偷將本應消滅的亞當肉體移植到自己的右手。
(4)碇源堂手上握有亞當的肉體、莉莉絲的肉體(NERV總部最下層)、莉莉絲的靈魂(綾波零)，打算將三者融合取得生命之果與智慧之果，自己成為神。
(5)結果莉莉絲的靈魂拒絕了他，碇源堂的人類補完計畫宣告失敗。
(6)想發動第三次衝擊的使徒與碇源堂都失敗，SELLE終於可以開始他們的人類補完計畫。
10.SELLE的人類補完計畫發動
(1)複製莉莉絲製作出的初號機，在消滅所有使徒後取得了生命之果，加上本身的智慧之果，成為了接近神的存在。可以準備發動第三次衝擊。
(2)但是碇真嗣還活著，他可以決定要不要發動第三次衝擊。
(3)因此SELLE計畫在所有使徒消滅後也要殺死真嗣，讓他不要來攪局。
(4)於是派出渚薰去當真嗣的好朋友，再讓真嗣發現自己的好友竟然是使徒，甚至要親手殺死自己好友，使真嗣身心崩潰。
(5)讓對一切絕望的真嗣自願性地發動第三次衝擊，消滅所有生命，達成SELLE心中的人類補完計畫。
(6)所有使徒被消滅後，SELLE也要接著消滅NERV，引發第三次衝擊。這邊有兩個版本，各從不同角度看待此事件：
(6-1)舊劇場版1：現實世界發生的事情。SELLE派遣戰略自衛隊侵入NERV總部殺了一堆人。
(6-2)電視版25、26話：碇真嗣的精神世界，絕望的真嗣透過與他人的對話，最後選擇不發動第三次衝擊。
11.舊劇場版1的劇情
(1)NERV消滅所有使徒後，SELLE派遣自衛隊消滅NERV，許多人被殺。
(2)美里千鈞一髮之際救出真嗣，自己卻傷重不治。
(3)明日香力戰SELLE的9台量產型福音戰士，卻被慘忍殺害。
(4)目睹一切的真嗣身心崩潰，SELLE的目的達成。(讓真嗣親眼看到好友渚薰與明日香死亡都是SELLE的計謀)
(5)初號機與9台量產型福音戰士，總共10台，這個數目主要是為了完成生命之樹架構，讓初號機從「接近神的存在」變成「等同神的存在」
(5-1)生命之樹可視為一種裝置，由10個球體構成，分別對應初號機和另外九台量產型福音戰士。(這十台此時都是「接近神的存在」)
(5-2)完成此儀式後，初號機真正成為「等同神的存在」，才有發動第三次衝擊的資格。
(5-3)生命之樹這設定的出現看似很突兀，但電視版第一集片頭曲動畫中，天空出現類似魔法陣的圖騰，那個就是生命之樹。
(6)成為神的初號機與量產型福音戰士，分別使用隆基努斯之槍貫穿自己，產生全球規模的反AT力場，全世界的人類都化作LCL。
(7)此時碇真嗣身處第三次衝擊的中心(因為他沒死)，有權決定第三次衝擊是否繼續發動。
(8)在這樣緊張的現實世界中，真嗣的精神世界是如何思考的，這段劇情就是電視版的25、26話。
12.電視版25、26話的劇情
(1)承襲舊劇場版的世界觀，第三次衝擊發動後，真嗣有資格決定是否要繼續發動。
(2) 因為全人類都化為LCL，意識融合在一起，真嗣的精神世界中可以聽到其他人的想法。
(3)於是真嗣在精神世界中與其他腳色終於有機會好好對話，這就是25、26話的重點。
(4)年幼時被父親拋棄、渴望自我認可的真嗣，個性內向又封閉的少年。
(5)但是隨著搭乘初號機，認識了明日香、綾波零、渚薰、葛城美里、同班同學的鈴原冬二等人，真嗣的內心漸漸不再封閉。
(6)然而冬二搭乘三號機受重傷，自己親手殺死了渚薰，讓真嗣感到害怕，重新封閉了心靈。
(7)真嗣在這樣內心不斷受到傷害與鼓舞的過程中，面臨到最後的選擇題：
- 要繼續執行第三次衝擊，消滅全人類？
- 還是維持現在這樣的世界？
(8)最後真嗣勇敢地選擇了後者，讓世界恢復正常。因此出現經典的畫面─許許多多的人對著真嗣笑著說恭喜～～
(9)這些祝福象徵著真嗣勇敢向前踏出了新的一步，不再怨天尤人，不再自我逃避。
(10)電視版全劇終。
下回預告：總結
